傳統中醫十三科
現代醫學的分科非常非常的細。雖然粗分有四個「主專科」：內科、外科、婦科、兒科。但是每一個主專科又分出許多的「次專科」。例如，光是一個內科，根據不同的醫院可能又分為許多不同的次專科：心臟內科、呼吸科、肝膽腸胃科、腎臟科（泌尿內科）、血液科、腫瘤科、內分泌科、傳染病科、免疫科、風濕科、神經科、兒科、神經內科、老年病科……等；有時很難正確的找到自己的這個病應該看哪一科或哪一個次專科。又例如治療牙齒的專科，「牙科」，被分為10個次專科，「口腔顎面外科、口腔病理科、齒顎矯正科、牙周病科、兒童牙科、牙髓病科、贋復補綴科、牙體復形科、家庭牙醫科及特殊需求者牙科」；同樣的難以拿捏應該到哪一科去診治。因為很難找到正確的醫學專科，因此有許多治病的先機被耽誤了，也不能明確指出是何種病，就統稱之為「現代病」。《轉法輪·第七講·醫院治病與氣功治病》中載有關於「現代病」的敘述：有的人檢查出來病了，也不知道叫甚麼名，都沒有見過的病，醫院統稱「現代病」。
上古時期就有醫學的分科
很早很早時期的傳統中醫能找到類似的分科存在；最早的分科，大約在公元前的周朝時期，那時的宮廷醫師已經分為4科。即：「食醫」、「疾醫」、「瘍醫」和「獸醫」。
1、食醫：管理帝王飲食。相當於現代的營養師。他們「掌和王之六食、六飲、六膳、百饈、百醬、八珍之齊」。
2、疾醫：「掌養萬民之疾病」，相當現代內科醫生，他們負責治療成人、小孩、婦人……等等的內科病以及流行病等。
3、瘍醫：「掌腫瘍、潰瘍、金瘍、折瘍」，相當於現代的外科和骨傷科醫師，可以使用的治法有外敷藥、腐蝕藥，也有用器具刮去膿血等的治療方法。
4、獸醫：「掌療獸病，療獸傷」，與現代獸醫類似。
到了唐朝，有太醫署[1]的配置，太醫署有分科，這個太醫署的分科有「醫」、「針」、「按摩」、「咒禁」四科。
後代的傳統醫學細分為十三科
傳統醫學，自古有相當於分科的概念。
上古時代，例如《黃帝內經·素問·異法方宜論》記載有5種不同的治療方法，各從不同的地域發展而來：「砭石」、「毒藥」、「灸焫」、「九針」和「導引按蹻」，「砭石者，亦從東方來；毒藥者，亦從西方來；灸焫者，亦從北方來；九鍼者，亦從南方來；導引按蹻者，亦從中央出也。」那些高手醫師就把這些治療方法都統合了，根據不同狀況而得心應手的取出來用以治病，「故聖人雜合以治，各得其所宜，故治所以異而病皆愈者，得病之情，知治之大體也。」嚴格說起來，上古時期就有了分科的雛形。以後的醫師都可以綜合的以這幾個方法治療複雜的各種病情。以下為九針圖
十三科這種醫療分科的方式，最早可追溯至北宋時期的熙寧九年（1076年）。當時的十三科包括大方脈、風科、小方脈、針灸、口齒、咽喉、眼科、耳科、瘡腫科、傷折科、金瘡科和書禁科。後來在元豐年間進行改制，又在嘉祐九科的基礎上進行了調整，最終成為九科的醫學分類體系。因此，北宋時期醫學的十三科只存在了很短的時間。而元朝和明朝的大部份時期，太醫院將醫學依然分為十三科。
北宋時期將醫學領域細分了，它已經具備了十三科，也有說是十四科的[2]。在元朝和明朝也都曾經進行了些許調整。
元朝的十三科包括大方脈、雜醫、小方脈、風科、產科、眼科、口齒科、咽喉科、正骨科、金瘡腫科、針灸科、祝由科和禁科。明朝維持了醫學的十三科[3]，但是稍有一些不同於元朝，包括大方脈、小方脈、婦人科、瘡瘍科、針灸科、眼科、口齒科、咽喉科、接骨科、傷寒科、金鏃科、按摩科和祝由科。這些分科的設立，反映了當時對於疾病和症狀的理解，並成為古代醫學教育和臨床實踐的組織架構。
明朝的十三科
以明朝的十三科為例，大概的做一些解釋。
大方脈：是專門治療成年人的疾病的，相當於現在的內科。
小方脈：是專門治療小兒疾病的，相當於現在的小兒科；過去叫「幼科」，也有叫「少小科」的，孫思邈稱之為「少小嬰孺」。
婦人科：婦人是指古代治療婦女病的專科，又稱「女科」。相當於現在的婦產科。《史記·扁鵲倉公列傳》[4]叫做「帶下科」。
瘡瘍科：瘡瘍是指皮膚損傷、潰瘍、膿瘍等病症。瘡瘍的治療以整體觀察為準，根據病情的不同，結合內治和外治方法，內治例如清熱解毒、活血化瘀、消散腫痛等，外治以敷藥粉或藥膏或貼藥布促進傷口的癒合和恢復。
針灸科：「針」和「灸」是2種不同的治療方法，但它們都是通過在特定穴位上通過調節氣血循環，平衡陰陽，以達到治療和預防疾病的目的。各種疾病包括疼痛、消化系統疾病、呼吸系統疾病等都可以以針灸的方式去治療。
眼科：眼科包括眼睛疾病的診斷治療，如赤眼（相當於現在的結膜炎）、青內障、綠內障（相當於現在的青光眼）等。
口齒科：口齒科涉及口腔中的疾病診斷治療，如風火牙痛（相當於現在的牙痛、牙齦炎、齒槽炎）等。
咽喉科：咽喉科則關注咽部和喉頭的疾病，如單乳蛾、雙乳蛾（相當於現在的扁桃腺炎、咽炎等），還有咽喉腫痛、聲音嘶啞等。
接骨科：有的時候稱之為「正骨科」，舉凡骨臼脫落、斷骨等都算在內。
傷寒科：相當於現在的內科的耳鼻喉科，所有的類似現在感冒的疾病都在這個科別治療。
金鏃科：是指專門治療刀、槍、箭傷等，類似現代醫學的「外科」，是看診當軍人或武鬥之時戰傷的一科。
按摩科：通過按壓、揉捏、推拿等手法，刺激穴位和經絡，調節氣血循環，改善健康狀態。和現在的按摩幾近相同，常被應用於緩解疼痛、減輕疲勞、促進血液循環等方面。
祝由科：使用特定的「祝說病由」和符咒等方法，達到治療和驅除邪氣，以及治療疾病的目的。《黃帝內經·素問·移精變氣論》[5]云，「古之治病，惟其移精變氣，可祝由而已」。古代用「祝說病由」的方式治療疾病，現在人多將之看成迷信。「祝說」，就是說上古時期，有的醫師不用藥物治病，而是用特殊的、玄的能力請神御鬼替人治病，這種醫師現在就稱之為「巫醫」，他們能祝禱鬼神替病患消災免難，解除病人的疾病痛苦。
十三科之外
除了明朝的十三科之外，其它各朝的科別，從名稱可以分辨大概指的是什麼樣的專科，其中一個「風科」可能少有人聽聞過。風，顧名思義是說的「吹風」的「風」的內涵，其實不對；這個風，通今日所用的「瘋」，是指頑疾的意思，也有說是精神上有了難以理解和治療的病態。有一種病，在《針灸大成》[6]裡面有幾處叫做「大風」的病，其中之一的大風病，症狀就是「髮眉脫落」，這就是類似於現在的「麻風」（也有寫成「痲瘋」的）病。
另外，還有一個「禁科」，它包含的東西很多，大概是禁術醫學和符咒醫學被應用於生活的。例如，《祝由十三科》有關「禁術」的記載的有：「禁溫疫時行、禁瘧病、禁瘡腫、禁喉痺、咒禁產運、禁金瘡、禁蠱毒、禁遁注、禁邪病、禁惡獸虎狼、禁蛇毒、禁蠍蜂、禁狗鼠、護身禁法、禁賊盜」等等，在不同的醫學或生活領域有不同的「禁法」可以運用。在運用這些術類的「禁法」之前，要求「必須先持知五戒、十善、八忌、四歸」。如果能照著做，才會有效：「皆能修治此者，萬神扶助，禁法乃行。」意思就是說：它注重心性修養，心性高可以被「神」來幫助；心性才是根本。《轉法輪》一書的作者李洪志大師這樣說了，「在道家世間小道上，不講修命，完全是算卦、看風水、驅邪、治病。這些世間小道上多採用它。」[7]還有「它帶著很低的很不好的信息。」，所以，一位修煉高層次法的人，不必也不要採用它。
[1] 大唐太醫署分「醫」、「針」、「按摩」、「咒禁」四科，其中醫科共有博士一名，助教一名，學生四十人。。
[2] 徐春甫《古今醫統大全》：「古醫十四科中有脾胃科，而今亡之矣。《道藏經》中頗有是說，自宋元以來止用十三科。考醫政，其一為風科，次傷寒科，次大方脈科，次小方脈科，次婦人胎產科，次針灸科，次眼科，次咽喉口齒科，次瘡瘍科，（即今之外科。）次正骨科，次金鏃科，次養生科，（即今修養家導引按摩嚥納是也。）次祝由科。（經曰：移精變氣者，可祝由而已。即今符咒禳禱道教是也。）國朝亦惟取十三科而已。」
[3] 《類經》云：按國朝醫術十三科：曰大方脈，曰小方脈，曰婦人，曰傷寒，曰瘡疾，曰針灸，曰眼，曰口齒，曰咽喉，曰接骨，曰金鏃，曰按摩，曰祝由。今按摩、祝由二科失其傳，惟民間尚有之。
[4] 《史記·扁鵲倉公列傳》：扁鵲名聞天下。過邯鄲，聞貴婦人，即為帶下醫；過雒陽，聞周人愛老人，即為耳目痹醫；來入咸陽，聞秦人愛小兒，即為小兒醫：隨俗為變。
[5] 《黃帝內經·素問·移精變氣論》：「古之治病，惟其移精變氣，可祝由而已」
[6] 《針灸大成》：委中者，血郄也。大風髮眉墮落，刺之出血。
[7] 《轉法輪·第五講·祝由科》：在道家世間小道上，不講修命，完全是算卦、看風水、驅邪、治病。這些世間小道上多採用它。它能夠治病，但它採用的方法並不好。我們不講它利用甚麼東西治的病了，但是我們修大法的人不要採用它，因為它帶著很低的很不好的信息。
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